枸杞作為傳統的藥食同源植物,含有豐富的果膠多糖。枸杞果膠多糖(LBPPs)是重要的生物活性成分,具有抗氧化、免疫調節、抗衰老等功效。盡管枸杞在健康領域應用較多,但對枸杞的遺傳圖譜、枸杞活性成份LBPPs的合成過程和調控機制知之甚少。這在很大程度上制約了枸杞的分子育種發展與推廣。
近日,中國科學院院士、生物物理研究所研究員陳潤生研究組與研究員陳暢研究組,在《基因組蛋白質組與生物信息學報》(Genomics,?Proteomics & Bioinformatics)上發表了題為Enzymes Repertoires and Genomic Insights into Lycium Barbarum Pectin Polysaccharides Biosynthesis的研究論文。該研究解析了枸杞基因組圖譜及活性成分,揭示了LBPPs的完整生物合成途徑,并鑒定了關鍵合成酶及糖代謝調控相關的RNA。
該研究基于三代測序技術、光學圖譜技術、自研高效三維基因組捕獲技術等方法,對枸杞進行de novo的基因組組裝,突破枸杞基因組高雜合、高重復的瓶頸,獲得枸杞高精度基因組圖譜。在此基礎上,研究解析了多糖活性酶基因庫CAZymes在LBPPs合成中的核心作用,尤其是在枸杞果膠多糖骨架延伸、側鏈合成和鏈修飾等方面的累積擴張。進一步,研究鑒定了一個關鍵鼠李糖糖基轉移酶基因RRT3020。研究顯示,RRT3020能夠顯著促進枸杞果膠多糖生成。同時,該研究解析了與枸杞果膠多糖代謝相關的長鏈非編碼RNA,為剖析基因調控提供了新視角。該研究在枸杞中建立了全面的果膠多糖合成模型,揭示了從糖轉運到多糖修飾的整個合成過程。
研究工作得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金、寧夏回族自治區重點研發計劃的支持。
論文鏈接
枸杞中果膠多糖合成和糖轉運示意圖
本文鏈接:科學家破譯枸杞子基因組圖譜http://www.lensthegame.com/show-12-495-0.html
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