設置
          • 日夜間
            隨系統
            淺色
            深色
          • 主題色

          龍舌蘭亞科首個染色體級別參考基因組構建

          2024-01-03 16:03:55 來源: 中國科學報

           6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          近日,中國熱帶農業科學院南亞熱帶作物研究所劍麻研究團隊在龍舌蘭亞科基因組及CAM進化機制上取得進展,該研究構建了龍舌蘭亞科首個染色體級別參考基因組,揭示了龍舌蘭亞科植物基因組增大的原因,發現了龍舌蘭科植物不同于其他植物的CAM進化分子機制,為龍舌蘭科植物(劍麻)分子育種和分析CAM進化提供基因組資源。相關研究成果發表在Horticuture Research上。6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          龍舌蘭亞科(中文名為劍麻)是多年生單次開花植物,開花時間在8~30年,這種生理特征導致劍麻的育種周期漫長。采用基因工程技術能縮短植物育種周期,目前劍麻缺乏參考基因組,阻礙了分子輔助育種技術在劍麻育種中的應用。然而較大的基因組、高比例的重復序列和多倍化,以及難以獲得純合系等因素阻礙了劍麻基因組的研究。6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          研究團隊利用Illumina、ONT和Hi-C測序數據,以國內主栽品種“東方紅1號”為材料,組裝了龍舌蘭亞科首個染色體級別基因組。該基因組總長度為4.87 Gb,共注釋出58,841個蛋白編碼蛋白基因。利用Hi-C輔助組裝技術將A. hybrid基因組拼接序列錨定30條染色體上,Scaffold N50 長度186.42 Mb。6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

            ?6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          A. hybrid形態、基因組特征和共線性分析     中國熱帶農業科學院供圖6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          研究人員通過多組學分析發現,兩次全基因組復制(WGD)事件、染色體重排和長時間低頻率的LTR重復序列插入可能是導致龍舌蘭科植物基因組增大、染色體增多的主要原因。并且,劍麻存在碳固定、次生代謝物合成等特有基因,蛋白/RNA/DNA合成與穩定相關蛋白受到正選擇,糖代謝、植物激素信號途徑基因、熱激蛋白和逆境脅迫相關轉錄因子發生基因擴張。6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          此外,研究發現,CAM途徑明星PEPC基因的數量沒有發生增加、沒有夜間表達的CAM型PEPC基因、沒有發現三類(R/K/H - D、A - S和R - G)已知的能顯著提高PEPC酶活性的氨基酸突變。劍麻PEPCK基因家族發生基因擴張、MAPK信號級聯、晝夜節律和植物激素信號轉導途徑的轉錄因子參與調控PEPCK基因表達。6sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          相關論文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhad2696sy流量資訊——探索最新科技、每天知道多一點LLSUM.COM

          本文鏈接:龍舌蘭亞科首個染色體級別參考基因組構建http://www.lensthegame.com/show-11-1983-0.html

          聲明:本網站為非營利性網站,本網頁內容由互聯網博主自發貢獻,不代表本站觀點,本站不承擔任何法律責任。天上不會到餡餅,請大家謹防詐騙!若有侵權等問題請及時與本網聯系,我們將在第一時間刪除處理。

          上一篇: 第十九屆中國圖象圖形學學會青年科學家會議舉行

          下一篇: 鋯/鉿氧簇的催化應用研究獲重要進展

          熱門資訊

          推薦資訊

          • 日榜
          • 周榜
          • 月榜
          主站蜘蛛池模板: 成人午夜视频精品一区| 久久精品免费一区二区喷潮| 99精品国产一区二区三区不卡| 亚洲av无码一区二区三区在线播放 | 精品一区二区三区在线成人 | 国产成人无码精品一区二区三区| 亲子乱av一区区三区40岁| 国产日韩精品一区二区在线观看播放| 久久人妻av一区二区软件| 亚洲免费视频一区二区三区| 韩国一区二区三区| 国产日韩一区二区三区在线播放| 久久一区二区三区精品| 成人精品一区二区三区不卡免费看| 冲田杏梨高清无一区二区| 无码视频一区二区三区| 精品国产一区二区三区AV| 国产91大片精品一区在线观看| 亚欧色一区W666天堂| 亚洲av午夜福利精品一区| 国产午夜精品一区二区三区 | 亚洲一区二区三区高清视频| 国产一区二区免费视频| 在线精品国产一区二区三区| 久久se精品一区精品二区国产| 日韩一区二区三区视频| 视频在线一区二区三区| 一区二区三区在线观看免费| 无码人妻精品一区二区蜜桃百度| 国产伦精品一区二区| 国产一区二区三区不卡在线看| 免费无码一区二区| 日韩电影在线观看第一区| 视频一区在线播放| 国产福利电影一区二区三区久久老子无码午夜伦不 | 天美传媒一区二区三区| 国产主播一区二区三区| 亚洲AV成人精品日韩一区18p | 国产在线观看一区二区三区精品| 精品国产一区二区三区久久蜜臀| 国产亚洲一区二区三区在线不卡|