來自愛爾蘭、法國和意大利的科學家攜手,成功構建了全球最大的數字微生物庫——“阿波羅”(APOLLO)。“阿波羅”囊括了247092個計算模型,其中包含迄今為止最全面的人體微生物組計算模型,有望增進科學家對人體微生物組及其對健康影響的理解。相關論文發表于最新一期《細胞系統》雜志。
研究團隊重點關注了細菌微生物組,即那些棲息于人體內外的細菌群落。他們基于真實樣本,創建了14451個微生物群落的計算模型,每個模型都展示了這些群落內不同微生物代謝如何隨身體部位、年齡和健康狀況的變化而變化。這些計算模型依據的樣本分布身體不同部位,跨越不同年齡,是迄今最全面的人類微生物組計算模型的集合?!鞍⒉_”還預測了與克羅恩病、帕金森病和兒童營養不良有關的關鍵代謝物,為開發診斷和治療新策略提供了寶貴線索。
研究團隊表示,這一數據庫將成為科學家探索微生物在人體內功能、微生物與健康和疾病相互作用的新利器,降低對繁瑣的活體生物實驗的依賴。
這一成果基于團隊長達十年的專業知識,從早期涵蓋數百種微生物的“重建和分析腸道微生物代謝”(AGORA)項目,到涵蓋數千種微生物的AGORA2,再到現在的“阿波羅”。
研究團隊表示,通過識別微生物代謝標志物,“阿波羅”可以幫助科學家開發非侵入性診斷工具,更早且更準確地診斷出疾病。這些模擬還能預測個體的微生物組與其飲食、藥物和健康狀況之間的相互作用,帶來更具針對性的益生菌、益生元和基于微生物組的個性化療法,幫助個人優化腸道健康,更有效地治療特定疾病。
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